Деревянные подоконники довольно прихотливы в уходе. Их нельзя сильно смачивать водой, очищать абразивными средствами, растворителями. Пыль стирают сухой или чуть влажной тряпочкой. Раз в 3-5 лет желательно наносить на поверхность подоконника дополнительный слой лака, краски или воска (существуют и специальные «фирменные» средства).

Пластиковые изделия неприхотливы. Их поверхность не имеет пор, благодаря чему бактерии на ней не скапливаются и уборка не доставляет особых хлопот. К тому же поверхность таких подоконников обладает повышенной износостойкостью и огнеупорностью благодаря специальной пленке на основе меломиновой смолы. Она защищает подоконную доску от грязи и воды, а также препятствует его желтению. Подоконники на основе ДСП и MDF не нуждаются в особом уходе. Подоконники можно мыть, используя мягкие (но не абразивные) моющие средства.

Полированная поверхность каменного подоконника боится царапин, а на мраморный нельзя проливать кислые и «окрашенные» жидкости (вино, чай, кофе, пепси, компот и т. п.). Подоконники из искусственного камня можно мыть мягкими средствами, а для устранения мелких царапин использовать полироли.